ANALISIS KERAGAMAN GENETIK DAERAH 3’UTR GEN RESEPTOR LIPOPROTEIN DENSITAS RENDAH (LDLR) DARI INDIVIDU ASAL PAPUA

Authors

  • Windasari Windasari Jurusan Kimia FMIPA Universitas Papua
  • Muhammad Fajar Islam Jurusan Kimia FMIPA Universitas Papua
  • Achmad Taher Jurusan Kimia FMIPA Universitas Papua

DOI:

https://doi.org/10.30862/psnmu.v7i1.22

Keywords:

LDLR, 3’UTR, keragaman genetik, papua

Abstract

Gen LDLR merupakan gen yang menyandi protein reseptor LDL yang berperan penting dalam pengaturan kadar kolesterol. Daerah 3’UTR merupakan daerah pengatur gen yang terletak pada bagian hilir dari urutan pengkodean protein. Daerah ini memiliki tingkat keragaman genetik yang tinggi yang dipertahankan selama proses evolusi melalui seleksi alam. Papua adalah salah satu wilayah di Indonesia yang memiliki keragaman suku yang tinggi, sehingga berpotensi memiliki keragaman genetik pada penduduknya. Walaupun demikian penelitian mengenai keragaman genetik pada penduduk Papua masih sangat sedikit, terutama yang terkait dengan daerah 3’UTR gen LDLR. Tujuan penelitian ini menganalisis keragaman genetik daerah 3’UTR gen LDLR pada 6 individu asal Papua. Tahapan penelitian meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi menggunakan PCR untuk memperbanyak jumlah gen target, elektroforesis dan sekuensing untuk mengetahui urutan basa-basa nukelotida. Hasil penelitian mengidentifikasi adanya 2 SNP pada daerah 3’UTR dengan keragaman nukleotida (π) 0,00177. SNP yang teridentifikasi terletak pada posisi *52 dan *504. Haplotipe yang dihasilkan adalah GG dan AA dengan keragaman sebesar 0,533 ± 0,172. Hasil ini menunjukkan bahwa keragaman genetik dari individu asal Papua adalah rendah.

Downloads

Published

2022-05-31

Issue

Section

Articles